В жеребьёвке примут участие восемь команд, одержавших победы в матчах пятого раунда Пути регионов – «Амкар», «Шинник», «Урал», «Тюмень», «Спартак Кострома», «Балтика», «Сочи» и победитель встречи «Чайка» – «Знамя Труда», которая состоится 17 октября в 19:00. Клубы, которые пройдут шестой раунд Пути регионов, попадут в первый этап 1/4 финала Пути регионов, где встретятся с командами, занявшими третьи места в групповом этапе Пути РПЛ.

Жеребьёвка пройдёт в три этапа. В первом, восемь шаров с названиями клубов-победителей пятого раунда Пути регионов разделят на две корзины. Во втором, поочерёдно отбирая шары из каждой корзины будут сформированы четыре пары клубов, которые сыграют друг с другом в шестом раунде Пути регионов.

Принимающим клубом в парах становится команда, которое провела меньше домашних матчей, начиная с четвёртого отборочного раунда Пути регионов. В случае равенства этого показателя в паре – для неё будет проведён третий этап жеребьёвки, который определит принимающий клуб. Для этого будет использована одна корзина с шарами с номерами от 1 до 4. Матч примет команда, для которой будет отобран шар с наибольшим номером.

Шестой раунд Пути регионов FONBET Кубка России пройдет 29–31 октября. Каждая пара проведёт один матч.