Главными соревнованиями для любительских футбольных клубов являются «Первенство России по футболу III Дивизиона» и «Кубок России по футболу (межрегиональный раунд)». Непосредственное проведение соревнованиями осуществляют 10 межрегиональных объединений РФС. Лучшие любительские клубы страны получают право сформировать любительскую сборную региона для участия в Кубке Регионов УЕФА - самом престижном европейском турнире, в котором имеют возможность принять участие футболисты, никогда не подписывавшие профессиональных контрактов. Кубок Регионов УЕФА проводится каждые два года. По завершении зонального этапа соревнований «Первенство России III дивизиона» с 2012 года будет проводиться финальный турнир для лучших молодежных команд профессиональных футбольных клубов.
В компетенции РФС находятся также соревнования ступенькой ниже – Первенства субъектов России, которые проводят региональные федерации футбола РФС. В некоторых субъектах турниры проходят по двум и более группам (лигам, дивизионам). Примерно 2000 таких коллективов соревнуются по стране, а класс ряда команд не уступает клубам III дивизиона.